Después del análisis geohidrológico se determina un sitio factible para la perforación exploratoria de un pozo profundo, para posteriormente proceder a la explotación del recurso hídrico cuando el objetivo es la captación o en su caso un pozo de absorción con la finalidad de infiltrar el agua pluvial en el subsuelo.

Basados en los resultados del análisis geohidrologico, geológico y geofísico se elige el tipo y capacidad del equipo de perforación para alcanzar las profundidades y diámetros especificados para la construcción del pozo
Los pozos tienen carácter exploratorio, debido a que las condiciones geohidrológicas existentes en un sitio solo se conocen a detalle a través de la exploración directa. En esta etapa se pueden obtener datos como estratigrafía, litología, localización y características de acuíferos, niveles y calidad de agua subterranea.